食欲不振、下痢、便秘、もたれ、嘔吐、胃痛などの消化器の疾患に使われる漢方薬は数多くあります。
例としては、六君子湯（りっくんしとう）、四君子湯（しくんしとう）、人参湯（にんじんとう）、小建中湯（しょうけんちゅうとう）、人参養栄湯（にんじんようえいとう）、補中益気湯（ほちゅうえっきとう）、十全大補湯（じゅうぜんだいほとう）、五苓散（ごれいさん）、平胃散（へいいさん）、安中散（あんちゅうさん）、麻子仁丸（ましにんがん）、大建中湯（だいけんちゅうとう）、黄連湯（おうれんとう）、啓脾湯（けいひとう）、桂枝加芍薬湯（けいしかしゃくやくとう）、胃苓湯（いれいとう）、真武湯（しんぶとう）、苓桂朮甘湯（りょうけいじゅつかんとう）、苓姜朮甘湯（りょうきょうじゅつかんとう）、半夏瀉心湯（はんげしゃしんとう）などがあります。
これらの漢方薬を使い分けて治療を行います。